Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE2Q495Y8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPDYE2Q495Y8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE2Q495Y8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms