Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBRG1Q3YBR2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms