Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS9Q3SYG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS9Q3SYG4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms