Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM30BQ3MIR4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM30BQ3MIR4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms