Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSR1Q2NL82 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms