Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6LQ2NKX8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC6LQ2NKX8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms