Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPRED3Q2MJR0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRED3Q2MJR0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms