Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCB5Q2M3G0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB5Q2M3G0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCB5Q2M3G0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms