Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTL8BQ17RB0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms