Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDO1Q16878 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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