Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA9Q16795 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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