Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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HIST2H2BEQ16778 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
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HIST2H2BEQ16778 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIST2H2BEQ16778 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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HIST2H2BEQ16778 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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HIST2H2BEQ16778 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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HIST2H2BEQ16778 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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HIST2H2BEQ16778 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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HIST2H2BEQ16778 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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HIST2H2BEQ16778 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST2H2BEQ16778 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST2H2BEQ16778 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST2H2BEQ16778 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST2H2BEQ16778 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST2H2BEQ16778 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST2H2BEQ16778 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST2H2BEQ16778 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST2H2BEQ16778 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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