Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B3Q16720 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP2B3Q16720 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
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