Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIL3Q16649 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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NFIL3Q16649 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
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