Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
DDB1Q16531 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
DDB1Q16531 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
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