Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RAB11BQ15907 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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RAB11BQ15907 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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RAB11BQ15907 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB11BQ15907 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RAB11BQ15907 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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RAB11BQ15907 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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RAB11BQ15907 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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RAB11BQ15907 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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RAB11BQ15907 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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