Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALX1Q15699 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALX1Q15699 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALX1Q15699 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
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