Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA2Q15560 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA2Q15560 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms