Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX1Q15475 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX1Q15475 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIX1Q15475 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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