Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP1Q15431 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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