Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABEP1Q15276 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RABEP1Q15276 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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RABEP1Q15276 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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RABEP1Q15276 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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RABEP1Q15276 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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RABEP1Q15276 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
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RABEP1Q15276 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABEP1Q15276 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
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