Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.24e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 522.41■■□□□ 1.184e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 222.25■■□□□ 1.154e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.144e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.074e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 321.51■■□□□ 1.034e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 221.44■■□□□ 1.024e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 220.99■□□□□ 0.954e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 220.75■□□□□ 0.914e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.914e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 220.29■□□□□ 0.844e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.834e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 220.24■□□□□ 0.834e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 SREBF1-222ENST00000583732 580 ntTSL 419.81■□□□□ 0.764e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.724e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.714e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.664e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.634e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.83■□□□□ 0.614e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 UROD-219ENST00000494399 1848 ntTSL 218.6■□□□□ 0.574e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 SREBF1-217ENST00000577897 536 ntTSL 418.43■□□□□ 0.544e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.534e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 INTS1-202ENST00000468115 3051 ntTSL 217.83■□□□□ 0.454e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.414e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 217.45■□□□□ 0.384e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 UROD-209ENST00000465678 756 ntTSL 216.97■□□□□ 0.314e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.294e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HYOU1-208ENST00000531682 319 ntTSL 216.05■□□□□ 0.164e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.094e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 UROD-212ENST00000472254 934 ntTSL 215.23■□□□□ 0.034e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 UROD-222ENST00000636836 1173 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.014e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 411.43□□□□□ -0.584e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.894e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.894e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)9.51□□□□□ -0.894e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 KMT2C-206ENST00000424877 5874 ntTSL 58.07□□□□□ -1.124e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 KMT2C-203ENST00000360104 11186 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.264e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 KMT2C-208ENST00000473186 12854 ntTSL 1 (best)5.62□□□□□ -1.514e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 MATR3-211ENST00000505625 7306 ntTSL 1 (best)6.91□□□□□ -1.37e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 MATR3-202ENST00000502422 2250 ntTSL 1 (best)5.47□□□□□ -1.537e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.282e-48■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)27.4■■□□□ 1.989e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 527.27■■□□□ 1.969e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 FLNA-211ENST00000465144 398 ntTSL 224.09■■□□□ 1.459e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)23.12■■□□□ 1.299e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.279e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.129e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-205ENST00000514511 1143 ntTSL 221.59■■□□□ 1.059e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.99e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.539e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.069e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.629e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 EP300-212ENST00000637592 100 ntTSL 5-1.95□□□□□ -2.729e-6■■□□□ 14
WDR43Q15061 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.645e-8■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 SF3B1-211ENST00000487698 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.395e-8■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.55e-8■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 SF3B1-203ENST00000414174 593 ntTSL 43.85□□□□□ -1.795e-8■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.685e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.555e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.215e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-207ENST00000461478 693 ntTSL 227.7■■■□□ 2.025e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 SEPT5-212ENST00000470814 2353 ntTSL 526.57■■□□□ 1.845e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.815e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-212ENST00000542044 1544 ntTSL 526.13■■□□□ 1.775e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.745e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 225.17■■□□□ 1.625e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.575e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-226ENST00000640813 1283 ntTSL 524.62■■□□□ 1.535e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 COPS6-210ENST00000496358 610 ntTSL 224.31■■□□□ 1.485e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.445e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.335e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 COPS6-206ENST00000468499 745 ntTSL 322.86■■□□□ 1.255e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.245e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.15e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 SEPT5-207ENST00000431044 3173 ntTSL 1 (best)21.48■■□□□ 1.035e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-222ENST00000545621 1282 ntTSL 1 (best)21.2■□□□□ 0.985e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.85e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-224ENST00000546226 2112 ntTSL 219.99■□□□□ 0.795e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.795e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 SEPT5-211ENST00000455843 4113 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.695e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 BCL6-210ENST00000496823 1138 ntTSL 318.44■□□□□ 0.545e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-219ENST00000544182 1542 ntTSL 218.18■□□□□ 0.55e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.465e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.395e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.375e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.35e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 416.32■□□□□ 0.25e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.175e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.015e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 HMBS-217ENST00000543543 1796 ntTSL 514.68□□□□□ -0.065e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 COPS6-208ENST00000474823 752 ntTSL 214.01□□□□□ -0.175e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.495e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 COPS6-204ENST00000426712 716 ntTSL 311.51□□□□□ -0.575e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 BCL6-209ENST00000480458 342 ntTSL 511.1□□□□□ -0.635e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 COPS6-209ENST00000483891 734 ntTSL 38.06□□□□□ -1.125e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 BCL6-207ENST00000470319 526 ntTSL 42□□□□□ -2.095e-7■■□□□ 13.9
WDR43Q15061 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.261e-49■■□□□ 13.9
Retrieved 100 of 3,951 protein–RNA pairs in 32.3 ms