Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RRS1Q15050 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
RRS1Q15050 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
RRS1Q15050 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRS1Q15050 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRS1Q15050 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RRS1Q15050 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms