Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCLAFQ15004 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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