Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 ZNF248-203ENST00000395867 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.433e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.023e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF248-207ENST00000494133 802 ntTSL 57.84□□□□□ -1.153e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.463e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 TCF20-201ENST00000335626 6237 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 DUXAP8-201ENST00000383038 1394 ntTSL 210.49□□□□□ -0.734e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 PLCB1-217ENST00000628900 560 ntTSL 47.89□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 AGAP1-208ENST00000448025 757 ntTSL 59.12□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 MAGI3-206ENST00000486456 897 ntTSL 519.92■□□□□ 0.782e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.013e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 RNF216-203ENST00000411812 563 ntTSL 513.6□□□□□ -0.233e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.334e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 XPC-205ENST00000476581 2944 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.384e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 RNF216-201ENST00000389900 3104 ntTSL 1 (best)10.04□□□□□ -0.83e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF782-201ENST00000289032 2355 ntTSL 27.03□□□□□ -1.284e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.544e-8■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.044e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.554e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF83-218ENST00000601257 704 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.784e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.164e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.434e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.484e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.834e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.741e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.531e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 519.51■□□□□ 0.713e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.863e-6■■■□□ 17.1
HLTFQ14527 AKAP9-204ENST00000394534 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.62□□□□□ -1.516e-8■■■□□ 17
HLTFQ14527 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.587e-7■■■□□ 17
HLTFQ14527 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.087e-7■■■□□ 17
HLTFQ14527 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -07e-7■■■□□ 17
HLTFQ14527 HECTD1-213ENST00000556224 3267 ntTSL 514.91□□□□□ -0.029e-6■■■□□ 17
HLTFQ14527 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.789e-6■■■□□ 17
HLTFQ14527 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.421e-7■■■□□ 17
HLTFQ14527 REV3L-205ENST00000422377 10964 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-6■■■□□ 17
HLTFQ14527 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 17
HLTFQ14527 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 17
HLTFQ14527 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■■□□ 17
HLTFQ14527 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.981e-6■■■□□ 17
HLTFQ14527 REV3L-206ENST00000434009 10644 ntTSL 22.76□□□□□ -1.971e-6■■■□□ 17
HLTFQ14527 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.812e-7■■■□□ 17
HLTFQ14527 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.337e-12■■■□□ 17
HLTFQ14527 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.627e-12■■■□□ 17
HLTFQ14527 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.713e-7■■■□□ 17
HLTFQ14527 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.227e-12■■■□□ 17
HLTFQ14527 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.227e-12■■■□□ 17
HLTFQ14527 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.313e-7■■■□□ 17
HLTFQ14527 PTPRM-203ENST00000400060 5030 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.68e-7■■■□□ 17
HLTFQ14527 PTPRM-202ENST00000400053 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.788e-7■■■□□ 17
HLTFQ14527 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.097e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-9■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 SCMH1-202ENST00000337495 3108 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.722e-9■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-9■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.292e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 FAM208B-205ENST00000473789 506 ntTSL 524.06■■□□□ 1.441e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 FAM208B-210ENST00000496681 522 ntTSL 323.48■■□□□ 1.351e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 FAM208B-213ENST00000532424 433 ntTSL 320.94■□□□□ 0.941e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 319.19■□□□□ 0.661e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 216.54■□□□□ 0.241e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.062e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.12e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.162e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.282e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.192e-7■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.758e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-215ENST00000489819 409 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.18e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 RORA-210ENST00000559343 577 ntTSL 412.94□□□□□ -0.348e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 RORA-212ENST00000560004 544 ntTSL 411.39□□□□□ -0.598e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-205ENST00000410107 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.678e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-214ENST00000489225 932 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.768e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-212ENST00000485764 608 ntTSL 510.01□□□□□ -0.818e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 RORA-205ENST00000551975 749 ntTSL 39.97□□□□□ -0.818e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.928e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -18e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.178e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.28e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.238e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-207ENST00000461400 320 ntTSL 37.15□□□□□ -1.268e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-204ENST00000397423 3528 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.328e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-208ENST00000474518 580 ntTSL 45.1□□□□□ -1.598e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 GCNT2-210ENST00000475577 547 ntTSL 44.43□□□□□ -1.78e-6■■■□□ 16.9
HLTFQ14527 TRIM56-202ENST00000412507 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.66■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 16.8
HLTFQ14527 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 16.8
HLTFQ14527 ZNF451-209ENST00000502749 790 ntTSL 519.19■□□□□ 0.666e-7■■■□□ 16.8
HLTFQ14527 ZNF451-216ENST00000510483 719 ntTSL 419.11■□□□□ 0.656e-7■■■□□ 16.8
HLTFQ14527 ZNF451-206ENST00000370711 609 ntTSL 413.26□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 16.8
HLTFQ14527 ZNF451-218ENST00000515290 581 ntTSL 44.98□□□□□ -1.616e-7■■■□□ 16.8
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