Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE1CQ14123 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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