Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
COL9A3Q14050 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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