Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX39BQ13838 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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