Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX1Q13596 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX1Q13596 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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