Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SQSTM1Q13501 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQSTM1Q13501 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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