Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SF3B2Q13435 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SF3B2Q13435 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms