Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2V1Q13404 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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