Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3BQ13214 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3BQ13214 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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