Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPS1Q13098 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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