Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MRPL28Q13084 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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