Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXC1Q12948 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXC1Q12948 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
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