Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXF2Q12947 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXF2Q12947 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms