Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TROQ12816 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TROQ12816 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TROQ12816 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TROQ12816 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TROQ12816 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TROQ12816 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
TROQ12816 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TROQ12816 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TROQ12816 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TROQ12816 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TROQ12816 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TROQ12816 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TROQ12816 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TROQ12816 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TROQ12816 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TROQ12816 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TROQ12816 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TROQ12816 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TROQ12816 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TROQ12816 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TROQ12816 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TROQ12816 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TROQ12816 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TROQ12816 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TROQ12816 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TROQ12816 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TROQ12816 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TROQ12816 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TROQ12816 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TROQ12816 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TROQ12816 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
TROQ12816 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TROQ12816 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TROQ12816 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TROQ12816 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
TROQ12816 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TROQ12816 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TROQ12816 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TROQ12816 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TROQ12816 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TROQ12816 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TROQ12816 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
TROQ12816 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TROQ12816 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
TROQ12816 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TROQ12816 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TROQ12816 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TROQ12816 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TROQ12816 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TROQ12816 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TROQ12816 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TROQ12816 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TROQ12816 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TROQ12816 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
TROQ12816 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TROQ12816 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TROQ12816 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TROQ12816 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TROQ12816 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TROQ12816 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
TROQ12816 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TROQ12816 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TROQ12816 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TROQ12816 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TROQ12816 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
TROQ12816 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TROQ12816 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TROQ12816 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TROQ12816 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TROQ12816 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TROQ12816 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TROQ12816 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TROQ12816 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TROQ12816 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TROQ12816 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TROQ12816 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TROQ12816 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TROQ12816 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TROQ12816 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TROQ12816 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TROQ12816 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TROQ12816 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TROQ12816 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TROQ12816 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TROQ12816 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TROQ12816 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TROQ12816 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TROQ12816 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TROQ12816 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TROQ12816 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TROQ12816 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TROQ12816 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TROQ12816 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TROQ12816 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TROQ12816 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TROQ12816 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TROQ12816 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TROQ12816 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
TROQ12816 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
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