Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TWF1Q12792 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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