Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1B1Q10567 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1B1Q10567 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1B1Q10567 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1B1Q10567 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1B1Q10567 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP1B1Q10567 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1B1Q10567 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1B1Q10567 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms