Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD86

INCA1, Protein INCA1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCA1Q0VD86 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCA1Q0VD86 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
INCA1Q0VD86 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
INCA1Q0VD86 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms