Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms