Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB2Q08289 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNB2Q08289 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms