Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL18Q07020 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL18Q07020 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL18Q07020 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL18Q07020 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL18Q07020 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms