Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms