Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
EN1Q05925 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EN1Q05925 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
EN1Q05925 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EN1Q05925 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
EN1Q05925 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
EN1Q05925 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EN1Q05925 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EN1Q05925 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EN1Q05925 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EN1Q05925 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
EN1Q05925 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EN1Q05925 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EN1Q05925 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EN1Q05925 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EN1Q05925 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EN1Q05925 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EN1Q05925 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EN1Q05925 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EN1Q05925 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EN1Q05925 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
EN1Q05925 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EN1Q05925 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EN1Q05925 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EN1Q05925 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EN1Q05925 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EN1Q05925 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EN1Q05925 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EN1Q05925 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EN1Q05925 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EN1Q05925 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EN1Q05925 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EN1Q05925 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EN1Q05925 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EN1Q05925 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EN1Q05925 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EN1Q05925 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EN1Q05925 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EN1Q05925 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EN1Q05925 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EN1Q05925 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EN1Q05925 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EN1Q05925 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EN1Q05925 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EN1Q05925 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EN1Q05925 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EN1Q05925 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EN1Q05925 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EN1Q05925 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EN1Q05925 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EN1Q05925 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EN1Q05925 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EN1Q05925 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EN1Q05925 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EN1Q05925 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EN1Q05925 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EN1Q05925 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
EN1Q05925 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EN1Q05925 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EN1Q05925 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EN1Q05925 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
EN1Q05925 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EN1Q05925 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EN1Q05925 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EN1Q05925 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EN1Q05925 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EN1Q05925 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
EN1Q05925 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
EN1Q05925 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EN1Q05925 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
EN1Q05925 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EN1Q05925 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
EN1Q05925 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EN1Q05925 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EN1Q05925 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EN1Q05925 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EN1Q05925 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EN1Q05925 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EN1Q05925 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EN1Q05925 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EN1Q05925 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EN1Q05925 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EN1Q05925 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EN1Q05925 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EN1Q05925 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EN1Q05925 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EN1Q05925 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EN1Q05925 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EN1Q05925 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EN1Q05925 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms