Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRKCDQ05655 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms