Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms