Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFHR1Q03591 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFHR1Q03591 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms