Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRG1Q02297 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRG1Q02297 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms